SD Muhammadiyah Metro Lampung berdiri tahun 1968 berdasarkan SK PP Muhammadiyah Majelis Pendidikan dan Pengajaran dan Kebudayaan dengan: No/ Tgl / Bln / Thn : 664/I-057/LP-68/1977. Asal muasal berdirinya SD Muhammadiyah Metro Lampung dilatarbelakangi oleh adanya lembaga pendidikan terkhusus sekolah keguruan yaitu PGA Muhammadiyah Metro yang semula 4 tahun menjadi PGA dan kemudian berubah menjadi PGA Muhammadiyah 6 tahun. Karena itu sekolah guru, maka memerlukan “Labschool”. Pada waktu itu PGA Muhammadiyah yang dikepalai oleh Amir Hamzah, membidani lahirnya SD Muhammadiyah Metro, bersama ketua bagian Pendidikan Muhammadiyahnya di jabat oleh M. Yusuf. Kemudian PGA Muhammadiyah menunjuk salah satu gurunya untuk menjadi kepala sekolah SD Muhammadiyah Metro yaitu Marsididie sebagai kepala sekolah pertama kalinya. Berikut ini adalah periode kepemimpinan kepala sekolah di SD Muhammadiyah Metro sejak berdiri sampai dengan tahun 2019, antara lain:

1. Periode Kepemimpinan Marsidie (tahun 1968–1970)
2. Periode Kepemimpinan R. Hadiwiyoto (tahun 1970–1973)
3. Periode Kepemimpinan Daud Sidiq, BA. (tahun 1980–1982)
4. Periode Kepemimpinan Drs. Zainal Abidin (tahun 1982-1997)
5. Periode Kepemimpinan Kustono, S.Ag. (tahun 1997–2007)
6. Periode Kepemimpinan Busro, S.Ag. (tahun 2007–2011)
7. Periode Kepemimpinan Zainal Abidin, M.Pd.I. (tahun 2011 – 2014)
8. Periode Kepemimpinan Ihwan (tahun 2014 – Sekarang)